Im Jahre 1926 gründete Rafael Larco Hoyle im Alter von 25 Jahren das Museo Larco.
Mit der Hilfe seines Vaters schaffte er es verschiedene archäologische Sammlungen der Nordküste mit insgesamt circa 45.000 Objekten zu erwerben.
Während der Katalogisierung für das Museum stellte er fest, dass viele der Stücke keiner der bis dato entdeckten Kulturen zugeordnet werden konnten.
Angesichts der archäologischen Informationslücken der Zwanziger Jahre des letzten Jahrhunderts begann er die archäologischen Stätten der Nordküste wissenschaftlich zu untersuchen und Ausgrabungen zu tätigen.
Diese Untersuchen führten die Entdeckung wichtiger Kulturen wie Cupisnique, Salinar, Virú und Lambayeque herbei. Larco wurde zum herausragenden wissenschaftlichen Entdecker der Mochica-Kultur.
Im Jahre 1946 schlug Rafael Larco die erste chronologische Einordnung der Kulturen der Nordküste vor.
Seine hervorragenden Kenntnisse der Landwirtschaft und der klimatischen Zusammenhänge nutzte er zur Untersuchung der während der Ausgrabungen identifizierten und stratigraphierten Sedimentschichten.