En 1926, à l’âge de 25 ans, Rafael Larco Hoyle fonda le Musée Larco.
Avec l’aide son père, il acquerra diverses collections originaires de la côte nord du Pérou et constitua un ensemble d’environ 45 000 pièces.
En classant les objets qui allaient être exposé dans le nouveau musée, il se rendit compte que de nombreuses pièces ne s’associaient pas avec celles des cultures jusqu’alors connues.
Pour pallier au manque d’informations archéologiques des années 1920, il décida de se lancer dans la fouille et l’étude scientifique de plusieurs sites archéologiques de la côte nord.
Ses recherches lui valurent la découverte d’importantes nouvelles cultures telles que Cupisnique, Salinar, Virú et Lambayeque. Il est, par ailleurs, le grand inventeur scientifique de la culture Mochica.
En 1946, il proposa la première chronologie relative des cultures de la côte nord du Pérou.
Il appliqua ses connaissances, dans les secteurs de l’agronomie et du comportement climatique, à l’étude des couches stratigraphiques identifiées lors de ses fouilles.